전라북도 보건당국은 이번 집중호우로 피해를 입은 지역 주민을 대상으로 수인성 감염병 등 각종 질병발생이 우려됨에 따라 예방대책으로 수해지역에 대한 방역소독 활동을 강화하도록 하고, 예방접종 등 감염병 예방활동을 대대적으로 펼치도록 긴급 지시하였다.

침수피해지역 시군보건소에서는 방역기동반을 편성하여 대대적인 방역활동에 나서도록 하고 침수지역에 방역약품 등을 보급하여 지역 내 감염병 예방활동을 전개토록 하고 의료기관에 대한 감시활동을 강화하는 등 환자발생시 신속히 대응토록 했다.

또한 복구작업 시 침수지역의 집기, 가구 등이 각종 분변 등 오물에 오염되었을 것을 고려하여 긴 옷, 고무장갑 등 보호장구를 착용하고, 식수는 안전한 식수와 물은 반드시 끓여 먹을 것과 침수지역 실내·외 소독을 주기적으로 실시하여 줄 것을 권고 하였다.

보건당국은 장마가 끝난 후 발생할 수 있는 전염병으로는 세균성이질, 장티푸스, 장출혈성대장균감염증과 같은 급성수인성감염병과 피부질환, 눈병, 일본뇌염 등이 발생할 수 있으므로 예방에 철저를 기하여 줄 것과 설사환자 발생 시 즉시 의료기관 및 관할 보건소에 신고해 줄 것을 당부하였다.